Die Christoph Merian Stiftung und der Kanton Basel-Stadt unterstützen das Cartoonmuseum in den Jahren 2012 bis 2014 mit einem Betriebskostenbeitrag von 90 000 Franken. Der Regierungsrat hat am Dienstag die entsprechenden Mittel aus dem Anteil der Einwohnergemeinde am Ertrag der Christoph Merian Stiftung genehmigt.
Das Cartoonmuseum Basel widmet sich als einziges Museum der Schweiz der gesamten Bandbreite der satirischen Kunst. Jährlich werden drei bis vier neue Wechselausstellungen präsentiert.